L'Archivio di Stato di Bergamo è stato istituito come Sezione il 15 aprile 1959 e solo da qualche anno ha potuto disporre di una sede idonea e attrezzata. La tardiva istituzione dell'Archivio di Stato ha avuto conseguenze non certo favorevoli per la raccolta e la conservazione del patrimonio documentario della provincia bergamasca, perchè molti fondi che nel frattempo erano stati versati all'Archivio di Stato di Milano sono andati distrutti nel bombardamento subito dall'istituto milanese nel 1943; in secondo luogo perchè in mancanza dell'Archivio di Stato numerosi archivi privati sono stati destinati e concentrati con altri fondi di enti pubblici nella locale biblioteca civica "Angelo Mai"; infine perchè molti archivi antichi di notevole interesse storico appartenenti ad uffici statali della provincia, che avrebbero dovuto essere versati, hanno subito durante la guerra trasferimenti e in qualche caso perdite irreparabili.

Attualmente il nucleo centrale dell'Archivio è costituito dal fondo Notarile i cui atti più antichi risalgono al 1243, dall'archivio del Dipartimento del Serio, dall'archivio della Delegazione e della Congregazione provinciale austriaca e dall'archivio del Catasto; va tenuto presente peraltro che ancora numerosi archivi devono essere versati.